CY3-phosphoramidite,CY3标记亚磷酰胺的化学结构
CY3-phosphoramidite是一种通过在荧光染料CY3分子结构上引入亚磷酰胺功能基团(phosphoramidite)所形成的修饰单体,用于合成荧光标记寡核苷酸、核酸探针或适配体等。该分子结合了有机磷酰胺合成策略与荧光检测技术,适用于DNA/RNA固相合成体系中的末端修饰。
从结构上看,CY3-phosphoramidite由三大部分组成:部分是以吡啶结构为核心的CY3染料本体,提供稳定的可见光吸收与荧光发射性能;第二部分是连接染料与合成模块的柔性或刚性链段,一般含有六碳或三碳桥接基团,用以缓解立体位阻并提升合成效率;第三部分为典型的亚磷酰胺结构单元,包含一个三价磷中心,配以二异丙基胺(diisopropylamino)和氰基乙氧基基团(2-cyanoethyl),具备高反应性。
在DNA/RNA固相合成中,CY3-phosphoramidite通常作为3'或5'末端修饰基团参与逐步延伸反应。其三价磷原子在弱酸催化下可与前一个核苷酸的5'-羟基发生磷酸酯键合反应,并经氧化处理转化为五价磷结构,从而稳定嵌入核酸主链。该过程可通过自动化合成仪进行精准控制,确保标记位点特异性且重现性好。
由于CY3染料具有优异的光学性能,其吸收峰通常位于550 nm左右,发射峰在570 nm附近,可用于多重荧光实验体系中的绿色或橙色通道。亚磷酰胺基团在合成前需保持干燥、避光和惰性气氛条件,以避免氧化水解。
产品名称:CY3-phosphoramidite,CY3标记亚磷酰胺
纯度:95%+
规格:mg/g
用途:科研
状态:固体/粉末/溶液

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仅用于科研,不能用于人体。小编axc
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